NVIDIA联合Google DeepMind等开放超2800种病毒蛋白复合物…
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AI 摘要依据下方信源原文自动整理，非原文转载病毒蛋白结构数据集发布
为应对未来可能出现的缺乏前期研究基础的新型病毒威胁，NVIDIA协同Google DeepMind以及欧洲分子生物学实验室下属欧洲生物信息学研究所（EMBL-EBI），共同发布了一个包含超2800种病毒蛋白复合物预测三维结构的数据集。该资源已接入AlphaFold Database，全球任意科研人员均可开放获取。此次新增的蛋白相互作用数据中，约30%的形态在以往作为实验测定结构主要存储库的蛋白质数据库中从未被记录，属于全新的科学发现。
AI模型与推理优化方案
本次结构预测工作基于Google DeepMind研发的AlphaFold2模型展开，该模型专用于推算蛋白质折叠形成的三维形态。为应对数千病毒蛋白质组的庞大计算需求，团队引入了NVIDIA BioNeMo推理运行时进行优化。这一优化方案显著提升了推理规模与效率，使得针对每种病毒内编码的多个相互作用蛋白群组进行复合物预测成为可能。
结构预测流程开源及背景
除数据集外，NVIDIA同步开源了用于生成上述数据的BioNeMo结构预测流程。这是一套经过GPU加速的完整工作流，允许研究人员针对自选的特定目标，直接从蛋白质序列出发推算其三维结构。全球发展中心的分析指出，至2050年全球面临与COVID-19同等严重大流行的概率约达50%。参与项目的格拉斯哥大学病毒研究中心专家表示，提前储备此类分子级知识，旨在避免在遭遇未知新病毒时陷入缺乏基础认知的被动局面。
为什么值得看
开源超2800种病毒蛋白复合物结构及GPU加速预测流程，为应对未来潜在公共卫生危机提前储备关键分子级知识。
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